工程发票的抵扣主要涉及增值税的抵扣，以下是详细的抵扣步骤和注意事项：
取得增值税发票
企业在购买工程材料、服务时，必须向供应商索取正规的增值税发票，并确保发票上的开票日期、商品名称、金额等信息与实际购买情况一致。
发票认证
企业收到增值税专用发票后，需在规定时间内进行认证。认证时，需核对发票号码、发票代码、开票日期、金额等信息是否与业务交易相符。认证后，将专用发票归入已认证的进项税额中。
进项税额的计算和抵扣
根据发票上标注的增值税税率和金额计算出应抵扣的增值税额，并在企业所得税申报表中进行相应的填写，实现增值税的抵扣。
增值税一般纳税人取得的2017年7月1日及以后开具的增值税专用发票和机动车销售统一发票，应自开具之日起360日内认证或登录增值税发票选择确认平台进行确认，并在规定的纳税申报期内，向主管国税机关申报抵扣进项税额。
特定条件下的额外抵扣
工程税务抵扣的支出金额需要按照工程各项支出之和计算，并且要求超过不动产原值的50%。比如，如果一家企业在进行装修时，总支出为100万元，不动产原值为80万元，则支出金额大于不动产原值的50%，即40万元，可以进行工程税务抵扣。
分包工程支出的抵扣
分包工程支出应按照分包商的纳税人资格和计税方法的选择来区分。一般纳税人专业分包的进项抵扣税率为9%。
发票勾选和统计
根据收到的增值税专用发票纸质发票在增值税综合服务平台勾选提交，申请统计，确认签名后，在电子税务局申报系统里面根据综合服务平台打印的进项发票勾选汇总表填在增值税附表二35栏，然后自动带入主表进项税额栏次，就可以抵扣当期的销项税额。
合同和发票的一致性
发票要求中强调，各单位原则上应选择具备一般纳税人资格的供应商签订协议，取得增值税专用发票，并确保“货物、劳务及服务流”、“资金流”、“发票流”三流一致。
通过以上步骤和注意事项，企业可以确保工程发票的增值税抵扣过程合规、准确，从而降低企业的税负。
