如果劳动者不愿意签订劳动合同，用人单位应当采取以下措施：
及时终止劳动关系：
用人单位应当在发现劳动者不愿意签订劳动合同后，尽快以书面形式通知劳动者终止劳动关系。这一措施应当在用工之日起一个月内完成，以避免后续的法律纠纷和经济补偿问题。
支付双倍工资：
如果用人单位未能在用工之日起一个月内终止与劳动者的劳动关系，那么从第二个月开始，用人单位需要向劳动者支付双倍工资，直至签订劳动合同或书面通知终止劳动关系之日。
经济补偿：
在终止劳动关系时，用人单位无需向劳动者支付经济补偿金。但是，用人单位应当依法向劳动者支付其实际工作时间的劳动报酬。
法律途径：
用人单位在处理此类问题时，应当遵循《中华人民共和国劳动合同法》及其实施条例的相关规定，确保所有操作合法合规，并有书面证据支持。
替代方案：
对于某些特殊情况下，用人单位可以考虑与员工签订《不愿意签订劳动合同的声明书》，并明确员工放弃双倍工资的赔款及签订无固定劳动合同的权利，同时员工需承担因此造成的法律责任。
公告通知：
用人单位可以在企业公告栏发布公告，证明已经通知劳动者签订劳动合同，但劳动者个人要求不签订劳动合同，以此作为解除劳动关系的依据。
工会证明：
要求工会出具相关证明，证明劳动者个人要求不签订劳动合同，以便在必要时作为解除劳动关系的证据。
及时开除：
对于拒绝签订合同的员工，用人单位应当立即与其解除劳动关系，以免对企业造成不必要的劳动用工风险。
通过以上措施，用人单位可以有效处理劳动者不愿意签订劳动合同的情况，同时保护自身的合法权益。建议用人单位在入职前即明确告知劳动者签订劳动合同的重要性和相关法律规定，以减少类似问题的发生。
